肥桃栽培历史悠久，虽当地群众亦未能道其详，只知此为祖传良种。肥桃究竟源于何代，传说有一千多年的历史，但考文字记载，并无如此久远。最早始见于1726年（清雍正四年）的《山东通志》记载：“桃产肥城者佳，临清次之，分销各处。”但在同一时期编纂的《古今图书集成》中，收集了全国六十一个产桃县份和若干个种类名称，而肥桃尚未列入该书，这证明那时的肥桃还不甚出名。时隔89年后的1815年（嘉庆二十六年），《肥城县志》载：“桃味美，他境莫能及，惟吕店、凤山、固留诸社出者尤佳”。至此，桃誉渐高。又隔了93年，至1908年（光绪三十四年）《肥城县乡土志》载：“远近千里外莫不知有肥桃者”，“东西洋诸国亦莫不知有肥桃者”。是时的肥桃已成为皇室贡品，不仅国内驰名，且蜚声海外。肥桃作为皇室贡品，使桃业生产遭受了挫折，据1934年的《肥城桃调查报告》记载：“其时（光绪年间）县知事因作为贡品，或馈赠上峰，差役于成熟之前，至各桃园查封贡品，凡栽培较佳，结果丰盛之园，多被封禁，不准他售，但能向差役纳贿，则可以免封。否则只能听之。其被封之园，届成熟期，差役持粗目之网摘果，凡不漏网之大果为贡品，其落网者则差役取为已有，无须给价。即作贡品者，给价与否，亦只能任差役之好恶，农民何敢与争。是以彼时农民种桃，反易招祸，多有伐去之者。”
除上述困难影响桃业发展外，还有栽培技术上的问题，据同一份调查报告记载：
“A·该县植桃，永不行剪枝。故桃树枝条悉生长过密，日光透射困难，空气不甚流通，又因不行剪枝之故，结果枝距树之中心甚远，虚耗养液，树力不能集中，致结果困难。
B·该县植桃施用肥料中，氮气质量实过于丰富，而磷酸肥料及加里质肥料又过于缺乏，故枝势过旺，料内营养液稀簿，易生芽叶，难成花芽。查磷酸肥料，为促进结果作用之要素，加里肥料为强壮枝条之必需品，故宜减少厩肥及豆饼之施用量，于每株桃，补施以小米糠或骨粉及草木灰等富于磷酸及甲里性质之肥料，脾健全其枝条，减除病害，并促进其结果能力。
C·虫害蔓延，妨碍桃树之同化作用。树最易受伤，因之于第二年或延之第三年尚无力结果。”
1937年，当地政府曾以“肥桃本为著名特产，徒以性易腐烂，不便运销，难期推广”为由，呈文请求“筹设制造肥桃罐头工厂”，以期开发肥桃资源。呈文未获批准，当时省主席韩复榘、建设厅长张鸿烈批示：“所请筹设制造肥桃罐头工厂脾利畅销一节，尚有见地。惟以肥桃产量太少，势难作大规模制造，成熟期间太短，工厂久闲，亦不合经济原理。又肥桃为粘核性，制罐工作甚感困难，且届成熟时期，其果肉多液化，若加水加热，势必溶解。有此数端，制造罐头，实属不易。”
1937年之后，战乱频仍，人民生活困苦，桃农多将桃树伐去改种粮食，肥桃生产大幅度下降。至1949年全县植桃面积仅存80余亩，2500余株，为战前的四分之一，产量十三万斤，不及战前的五分之一。
